Godišnji proračun Centra hrvatskih studija utemeljen je na trojnom ugovoru između triju zainteresirana partnera, a program se omogućuje i radi na temelju njihova doprinosa. Radi se o ovim partnerima:
- Ministarstvo znanosti obrazovanja i sporta Republike Hrvatske
- Macquarie Sveučilište, koje daje doprinos na temelju broja studenata upisanih u program hrvatskih studija
- Hrvatska znanstvena zaklada
Godine 1998. ondašnje Ministarstvo znanosti i tehnologije preuzelo je obavezu financiranja programa hrvatskog studija i istraživačkog Centra. Godine 2003. sklopljen je novi trojni ugovor na deset godina između Ministarstva znanosti, obrazovanja i sporta, Macquarie Sveučilišta i Hrvatske znanstvene zaklade koji osigurava doprinos Ministarstva u iznosu od otprilike AUD 75,000 do godine 2014. To predstavlja otprilike jednu trećinu sredstava potrebnih za održavanje Centra hrvatskih studija. U posljednje dvije godine Ministarstvo obrazovanja i sporta osiguralo je dopunska sredstva u u obliku tri jednokratne donacije u iznosu od AUD 65,000 odnosno dva puta AUD 70,000 kao potporu studiju i pomoć Hrvatskoj znanstvenoj zakladi, koja time dobiva prostor da poveća glavnicu zaklade i dugoročno osigura sredstva za potporu studiju.
Macquarie Sveučilište na temelju broja upisanih studenata dobiva sredstva od australskog Federalnog ministarstava obrazovanja i njima pokriva otprilike jednu trećinu ukupnog proračuna Centra. Hrvatska znanstvena zaklada osigurava ostatak sredstava, što ugovorno iznosi otprilike jednu trećinu ukupnog troška studija. Zahvaljujući donacijama iz Ministarstva obrazovanja u posljednje tri godine taj je trošak za Zakladu bio znatno manji, a svrha toga je dugoročna obnova Zaklade i njezino pozicioniranje za preuzimanje trajne brige o opstanku hrvatskog studija i Centra.
Da bi se sve ovo ostvarilo, Zakladi je potrebna pomoć zajednice u aktivnostima prikupljanja potpore, dobivanju donacija, dobivanju novih članova i tome slično.