Upravni odbor Hrvatske znanstvene zaklade upravlja Zakladom, a bira ga članstvo na Godišnjem saboru Zaklade. Svi članovi Upravnog odbora u Zakladi rade dobrovoljno i za to ne primaju nikakvu novčanu naknadu.

Upravni odbor Hrvatske znanstvene zaklade sastoji se od 16 izabranih članova:

• 1 rektor Macquarie Sveučilišta ili njegov predstavnik u ulozi počasnog predsjednika Zaklade.
• 4 izabrana člana Izvršnog odbora u okviru Upravnog odbora (Predsjednik HZZ-a, dopredsjednik HZZ-a, tajnik HZZ-a i rizničar HZZ-a).
• 11 članova Upravnog odbora

U ovogodišnjem mandatu Upravni odbor sačinjavaju slijedeće osobe koje u tim HZZ-a donose stručnost sa svog područja specijalizacije, zajedno s vještinama i iskustvom u predanom radu:

• gđa. Eva Prpic, PREDSJEDNICA
• fra Ivo Tadic, DOPREDSJEDNIK
• g. Mirko Stefulj, TAJNIK
• gđica. Christine Klaričić, RIZNIČARKA
• g. Berislav Becarevic
• g. Marijan Bekic
• g. Luka Budak
• g. Tom Buljan
• gđica. Helena Ivec
• g. Marko Jakovac
• gđa. Dijana Lepan
• gđica. Emma Plascek
• dr. Boris Skvorc
• g. Branimir Sprajcer
• gđica. Manda Vulic